絶滅（EX） 4種
| ヤマボタルガイ | Cionella lubrica |
| カスガコギセル | Pictophaedusa hungerfordiana |
| カワシンジュガイ | Margaritifera laevis |
| カラスガイ | Cristaria plicata |
絶滅危惧ⅠA類（CR） 9種
| サドヤマトガイ | Japonia sadoensis |
| イトウムシオイガイ | Dicharax (Sigmacharax) itonis itonis |
| ハリマムシオイガイ | Dicharax japonicus japonicus |
| タダムシオイガイ | Dicharax tadai |
| ホラアナゴマオカチグサガイ | Cavernacmella kuzuuensis |
| サナギガイ | Pupilla cryptodon |
| ハンジロギセル | Pliciphadusa hemileuca hemileuca |
| カワリダネビロウドマイマイ | Nipponochloritis silvaticus |
| フネドブガイ | Anemina arcaeformis |
絶滅危惧ⅠB類（EN） 10種
| ヤサガタイトウムシオイガイ | Dicharax (Sigmacharax) itonis shiotai |
| アキヨシミジンツボ | Akiyoshia uenoi |
| イボイボナメクジ | Granulilimax fusicornis |
| ナタネキバサナギガイ | Vertigo eogea eogea |
| ホソヒメギセル | Tyrannophaedusa (Aulacophaedusa) gracilispira |
| ヒロクチコギセル | Reinia variegata |
| カサネシタラガイ | Sitalina insignis |
| コオオベソマイマイ | Aegista (Aegista) proba minula |
| オオケマイマイ | Aegista (Plectotropis) vulgivaga vulgivaga |
| リシケオトメマイマイ | Aegista collinsoni lischkeana |
絶滅危惧Ⅱ類（VU） 12種
| ゴマオカタニシ | Georissa japonica |
| ヤマキサゴ | Waldemaria japonica |
| オオピルスブリムシオイ | Dicharax sp. cf. pilsbryi |
| ヒダリマキゴマガイ | Diplommatina (Sinica) pusilla pusilla |
| クルマヒラマキガイ | Hippeutis cantori |
| カワモトギセル | Tyrannophaedusa (Decolliphaedusa) kawamotoi |
| ツシマナガキビ | Trochochlamys longissima |
| イズモマイマイ | Euhadra idzumonis |
| ダイセンニシキマイマイ | Euhadra sandai daisenica |
| マツカサガイ | Pronodularia japanensis |
| ニセマツカサガイ | Inversiunio yanagawaensis |
| イシガイ | Nodularia douglasiae nipponensis |
準絶滅危惧（NT） 17種
| ベニゴマオカタニシ | Georissa shikokuensis |
| オオウエゴマガイ | Diplommatina (Sinica) labiosa tenuiplica |
| アズキガイ | Pupinella rufa |
| ホラアナミジンニナ | Moria nipponica |
| マルタニシ | Cipangopaludina chinensis laeta |
| オオタニシ | Cipangopaludina japonica |
| ヒメマルマメタニシ | Gabbia kiusiuensis |
| クチマガリスナガイ | Bensonella plicidens |
| スナガイ | Gastrocopta armigerella armigerella |
| キセルガイモドキ | Mirus reinianus |
| チビギセル | Placeophaedusa expansilabris |
| モリヤギセル | Vastina (Vastina) vasta moriyai |
| クロツノナメクジ | Deroceras sp. |
| タキカワオオベソマイマイ | Aegista (Aegista) friedeliana aperta |
| チョウシュウシロマイマイ | Aegista hiroshifukudai |
| イワミマイマイ | Euhadra awaensis occidentalis |
| カタハガイ | Obovalis omiensis |
情報不足（DD） 15種
| ゴマガイ | Diplommatina (Sinica) cassa |
| ダイオウゴマガイ | Diplommatina (Sinica) nakashimai |
| ヒメゴマガイ | Diplommatina (Sinica) sp. |
| マメタニシ | Parafossarulus manchouricus japonicus |
| ヒメヒラマキミズマイマイ | Gyraulus pulcher |
| カワコザラガイ | Laevapex nipponica |
| スジケシガイ | Carychium noduliferum |
| ヤマトキバサナギガイ | Vertigo japonica |
| トサギセル | Pliciphadusa tosana tosana |
| オオコウラナメクジ | Nipponarion carinatus |
| ハクサンベッコウ | Nipponochlamys hakusanus |
| コウベマイマイ | Aegista (Aegista) kobensis kobensis |
| コビトオオベソマイマイ | Aegista pygmaea |
| マシジミ | Corbicula leana |
| ウエジマメシジミ | Pisidium (Odhneripisidium) uejii |